Sidebar

services

Edita Kriukiene  

Tel.nr.: +370 5 2234351  
El.p.:

ORCID 

 

 CV atsisiuntimui
Moksliniai interesai: DNR žymėjimas, DNR modifikuojantys fermentai, fermentų inžinerija, netipinės metiltransferazių reakcijos, sintetiniai SAM kofaktoriai
Epigenominiai tyrimai, DNR ir RNR modifikacijos, genominiai DNR modifikacijų profiliavimai, naujos kartos sekoskaita
Vienos ląstelės epigenomika, DNR modifikacijų nustatymas atskirose ląstelėse
Epigenetinių žymenų nustatymas
Laisvai cirkuliuojančios DNR pritaikymas ligų diagnostikai
Vystymosi ir vėžio epigenomika, vaistų tyrimai 
Pareigos, darbovietė: Vyriausioji mokslo darbuotoja 
Išsilavinimas:
 Biochemijos mokslų daktarė 
Patirtis: 2022–dabar - Vyriausioji mokslo darbuotoja, Biotechnologijos institutas, Gyvybės mokslų centras, Vilniaus universitetas
2015–dabar - Grupės vadovė, Biologinio DNR modifikavimo skyrius, Biotechnologijos institutas, Gyvybės mokslų centras, Vilniaus Universitetas
2012–2022 - Vyresnioji mokslo darbuotoja, Biotechnologijos institutas, Gyvybės mokslų centras, Vilniaus Universitetas
2011–05 - Vizituojanti mokslininkė, Krembil Family Epigenetics laboratory, Centre for Addiction and Mental Health (CAMH), Toronto universitetas, Kanada
2008–2011 - Podoktorantūros tyrimai, mokslo darbuotoja, Biologinio DNR modifikavimo skyrius, Biotechnologijos institutas, Vilniaus Universitetas
1998–2007 - Doktorantė/jaunesnioji mokslo darbuotoja (įskaitant 1,5 metų motinystės atostogas) Prokariotų genų inžinerijos laboratorija, Biotechnologijos institutas, Vilnius, Lietuva
Dėstomi dalykai: Paruošimas ir dėstymas trumpo kurso “Epigenomika” Sistemų biologijos kurso paskaitose 2021 biochemijos, molekulinės biologijos ir biofizikos magistro studijų studentams (pagrindinis dalyko dėstytojas Prof. Saulius Serva, VU). 
Vadovavimas doktorantams: Janina Ličytė (2013–2018), biochemija, Vilniaus universitetas: “Nauji metodai DNR modifikacijų profiliavimui”.
Milda Narmontė (2016–2021), biochemija, Vilniaus universitetas: “DNR modifikacijų analizė neuroblastomoje, nauji hmC nustatymo metodai”.
Kotryna Skardžiūtė (2020–dabar) biochemija, Vilniaus universitetas: “DNR modifikavimo ir chromatino dinamika ląstelių vystymesi”. 
Apdovanojimai: 2013 VU Rektoriaus apdovanojimas už išskirtinius mokslinius pasiekimus.
2015 VU Rektoriaus apdovanojimas už geriausią taikomąjį projektą (3 autoriai)
2020 VU Rektoriaus apdovanojimas už išskirtinius mokslinius pasiekimus. 
Publikacijos:

LABT_LMAVB

1. Ličytė J., Kvederavičiūtė K., Rukšėnaitė A., Godliauskaitė E., Gibas P., Tomkutė V., Petraitytė G., Masevičius V., Klimašauskas S., Kriukienė E. (2022) Distribution and regulatory roles of oxidized 5-methylcytosines in DNA and RNA of the Basidiomycete fungi Laccaria bicolor and Coprinopsis cinereal. Open Biol. 12: 210302. https://doi.org/10.1098/rsob.210302. IF 5.93. Q1.
2. Narmonte M., Gibas P. Daniūnaitė K., Gordevičius J., Kriukiene E. (2021). Multiomics Analysis of Neuroblastoma Cells Reveals a Diversity of Malignant Transformations. Front Cell Dev Biol 9, 727353. IF 6.68. Q1.doi: 10.3389/fcell.2021.727353.
3. Gordevičius J, Narmontė M, Gibas P, Kvederavičiūtė K, Tomkutė V, Paluoja P, Krjutškov K, Salumets A, Kriukienė E. (2020) Identification of fetal unmodified and 5-hydroxymethylated CGs in maternal cell-free DNA for non-invasive prenatal testing, Clin Epigenetics, 12, 153. IF 6.03. Q1. doi: 10.1186/s13148-020-00938-x.
4. Ličytė J, Gibas P, Skardžiūtė K, Stankevičius V, Rukšėnaitė A, Kriukienė E. (2020) A bisulfite-free approach for base-resolution analysis of genomic 5-carboxylcytosine. Cell Reports, IF 9.4. 32:108155. doi: 10.1016/j.celrep.2020.108155.
5. Gibas P, Narmontė M, Staševskij Z, Gordevičius J, Klimašauskas S, Kriukienė E. (2020) Precise genomic mapping of 5-hydroxymethylcytosine via covalent tether-directed sequencing. PLoS Biol. 18(4):e3000684. IF 8.3. doi: 10.1371/journal.pbio.3000684.
6. Daniūnaitė K, Jarmalaitė S, Kriukienė E. (2019) Epigenomic technologies for deciphering circulating tumor DNA. Curr Opin Biotechnol. 55:23-29. IF 8.3. doi: 10.1016/j.copbio.2018.07.002.
7. Staševskij Z., Gibas P., Gordevičius J., Kriukienė E.* and Klimašauskas S.* (2017) Tethered Oligonucleotide-Primed sequencing, TOP-seq: a high-resolution economical approach for DNA epigenome profiling. Mol Cell, 65, 1-11. * - corresponding authors. IF 14.708. doi: 10.1016/j.molcel.2016.12.012.
8. Labrie V., Buske O. J, Oh E., Jeremian R., Ptak C., Gasiūnas G., Maleckas A., Petereit R., Žvirbliene A., Adamonis K., Kriukienė E., Koncevičius K., Gordevičius J., Nair A., Zhang A., Ebrahimi S., Oh G., Šikšnys V., Kupčinskas L., Brudno M., and Petronis A. (2016) Lactase nonpersistence is directed by DNA-variation-dependent epigenetic aging. Nature Struct. Mol. Biol. 23: 566-573. IF 13.338. doi: 10.1038/nsmb.3227.
9. Tomkuvienė M, Kriukienė E, Klimašauskas S. (2016) DNA Labeling Using DNA Methyltransferases. Adv Exp Med Biol. 945, 511-535. IF 2.5. doi: 10.1007/978-3-319-43624-1_19.
10. Liutkevičiūtė Z. & Kriukienė E., Ličytė J, Rudytė M, Urbanavičiūtė G, Klimašauskas S. (2014) Direct decarboxylation of 5-carboxylcytosine by DNA C5-methyltransferases. J Am Chem Soc. 136, 5884-7. IF 12.113. doi: 10.1021/ja5019223.
11. Kriukiene E., Labrie V., Khare T., Urbanavičiūtė G., Lapinaitė A., Koncevičius K., Li D., Wang T., Pai S., Ptak C., Gordevičius J., Wang SC., Petronis A., Klimašauskas S. (2013) DNA unmethylome profiling by covalent capture of CpG sites. Nat Commun, 4:2190. IF 10.742. doi: 10.1038/ncomms3190.
12. Khare T., Pai S., Koncevicius K., Pal M., Kriukienė E., Liutkevičiūtė Z., Irimia M., Jia P., Ptak C., Xia M., Tice R., Tochigi M., Moréra S., Nazarians A., Belsham D., Wong A.H., Blencowe B.J., Wang S.C., Kapranov P., Kustra R., Labrie V., Klimasauškas S., Petronis A. (2012) 5-hmC in the brain is abundant in synaptic genes and shows differences at the exon-intron boundary. Nat Struct Mol Biol. 19, 1037-43. IF 11.902. doi: 10.1038/nsmb.2372.
13. Kriukienė E., Liutkevičiūtė Z., Klimašauskas S. (2012) 5-Hydroxymethylcytosine - the elusive epigenetic mark in mammalian DNA. Chem Soc Rev., 41, 6916-30. IF 24.892. doi: 10.1039/c2cs35104h.
14. Liutkevičiūtė Z., Kriukienė E., Grigaitytė I., Masevičius V., Klimašauskas S. Methyltransferase-directed derivatization of 5-hydroxymethylcytosine in DNA. (2011) Angew Chem Int Edit. 50, 2090-3. Angew Chem. (2011), 123, 2138-2141. IF 9.24. doi: 10.1002/anie.201007169.
15. Jakubauskas A. Kriukienė E. Trinkūnaitė L., Šapranauskas S. Jurėnaitė-Urbanavičienė S., Lubys A. Bioinformatic and partial functional analysis of pEspA and pEspB, two plasmids from Exiguobacterium arabatum sp. nov. RFL1109. (2009) Plasmid. 61, 52-64. doi: 10.1016/j.plasmid.2008.09.004.
16. Klimašauskas S., Gerasimaitė R., Urbanavičiūtė G., Kriukienė E., Lukinavičius G., Petronis A., Epigenome profiling via DNA methyltransferase-directed labeling (2008) Cellular Oncology, 30, 232.
17. Jurėnaitė-Urbanavičienė S., Šerkšnaitė J., Kriukienė E., Giedrienė J., Venclovas C., Lubys A.. Generation of DNA cleavage specificities of type II restriction endonucleases by reassortment of target recognition domains. (2007) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 104, 10358-10363. IF 9.6. doi: 10.1073/pnas.0610365104.
18. Kriukienė E. Domain organization and metal ion requirement of the type IIS restriction endonuclease MnlI. (2006) FEBS Letters 580, 6115-6122. IF 3.7. doi: 10.1016/j.febslet.2006.09.075.
19. Kriukienė E., Lubienė J., Lagunavicius A., Lubys A. MnlI-The member of H-N-H subtype of Type IIS restriction endonucleases. (2005) Biochim. Biophys. Acta 1751, 194-204. IF 2.5. doi: 10.1016/j.bbapap.2005.06.006.
Akademinis bendradarbiavimas: Prof. Arturas Petronis. CAMH, University of Toronto/Canada. DNR modifikacijų analizė ligų diagnostikoje.
Prof. Andres Salumets. Tartu University/Competence centre on Health Technologies/ Estonia. Bendradarbiavimas neinvazinės ligų diagnostikos tyrimuose.
Prof. Haruhiko Koseki. RIKEN Yokohama/Japan. Polycomb baltymų kompleksų tyrimai CG salose.
Prof. K Gurova. Department of Cell Stress Biology,
Roswell Park Comprehensive Cancer Center, Buffalo, USA. Vėžinių ląstelių tyrimai. 

Projektai, stipendijos:

Dalyvavimas projektuose (per pastaruosius 5 metus):
2021–2024 - Nr. S-MIP-21-1. LMT mokslininkų grupių projektas. „DNR modifikavimo ir chromatino dinamikos tyrimas sveikų ir vėžinių ląstelių diferenciacijoje“, projekto vadovė.
2016-09–2023-02 - Europos mokslo taryba, dotacija patyrusiems mokslininkams“ (EpiTrack), vykdytoja.
2018–2022 - 09.3.3-LMT-K-712-01-0041 Europos socialinis fondas pagal sutartį su LMT, Mokslininkų kvalifikacijos tobulinimas vykdant aukšto lygio MTEP projektus No. 09.3.3-LMT-K-712 „Vienos molekulės TOP-seq - inovatyvi technologinė platforma ankstyvai neinvazinei vėžio ir kitų epigenetinių susirgimų diagnostikai”, projekto vadovė.
2017–2020/11 MIP-17-58. „Vienos ląstelės technologija genominio DNR modifikavimo tyrimui ir neuroblastomos epigenetinio heterogeniškumo analizė“. Lietuvos mokslo taryba. Projekto vadovė.
2013–2016 [ MIP-045/2013. LMT mokslininkų grupių projektas „Genominių CG sekų analizė”, Lietuvos mokslo taryba. Projekto vadovė. 
Kvalifikacijos kėlimas, sertifikatai: 2008 09 TATAA Biocenter – realaus laiko PGR kursai, Freising, Vokietija
2014 Ion Torrent Proton sekoskaitos sistema. Sekoskaita ir duomenų analizė, Vilnius, Lietuva 
Mokslo sklaida: 2015, 2016 Mokslo populiarinimo paskaitos aukštesniųjų klasių mokiniams “What is Epigenomics”.
2017-02-28 DELFI: Lietuvos biotechnologai pateko į pasaulinio garso leidinį
2017-06, journal Spectrum; 1(26)/2017. E. Kriukienė. Unikalūs molekuliniai įrankiai padės pastebėti artėjančią ligą.
2017-09-07 Lietuvos žinios. E.Kriukienė. Unikalūs molekuliniai įrankiai padės pastebėti artėjančią ligą
2017-09-23 15 min. VU mokslininkai atrado unikalų metodą artėjančioms ligoms nustatyti
Kalbos: Lietuvių (gimtoji), anglų, vokiečių, rusų

 

Mokslas

Siekdami užtikrinti jums teikiamų paslaugų kokybę, Universiteto tinklalapiuose naudojame slapukus. Tęsdami naršymą jūs sutinkate su Vilniaus universiteto slapukų politika. Daugiau informacijos